Consanguinité chez le spitz loup : calcul du Coefficient of Inbreeding (COI ou IC)

Pour tenter de se prémunir des maladies, il vaut mieux limiter la consanguinité chez le spitz loup… Mais comment faire ?

Si vous avez lu le site, vous avez vu que notre recommandation est de calculer un Inbreeding Coefficient sur au moins 20 générations et de chercher à l’avoir le plus faible possible.

Il est temps de détailler ce qu’est l’Inbreeding Coefficient ou IC ou encore Coefficient of inbreeding (COI) donc en français : le Coefficient de consanguinité.

Pour un individu, il représente la probabilité que deux allèles de chaque locus (emplacement occupé par un gène sur un chromosome) soient identiques par descendance à ceux d’ancêtre(s) des deux parents.

Un individu est dit « consanguin » s’il y a une boucle dans son pedigree. Une boucle est définie par un chemin qui court d’un individu à un ancêtre commun par un parent et descend à l’autre parent, sans passer deux fois par personne.

Ce sera plus clair sur un dessin

Commençons par regarder un pedigree : on voit que 2 noms apparaissent 2 fois

Si on fusionne les ancêtres communs, on voit clairement apparaître les 2 boucles dont il est question dans la définition, l’une en jaune, l’autre en jaune & vert.

Le nombre de boucles est toujours le nombre d’ancêtres communs des parents. (ici donc 2)

Si un individu est consanguin, le coefficient est calculé en ajoutant toutes les probabilités qu’un individu reçoive le même allèle du côté paternel et maternel.

Comme chaque individu a 50% de chances de transmettre un allèle à la nouvelle génération, la formule dépend de 0,5 élevé à la puissance du nombre de générations séparant l’individu de l’ancêtre commun de ses parents, tant du côté paternel que maternel. Ce nombre de générations peut être calculé en comptant le nombre d’individus se trouvant dans la boucle définie précédemment.

Ainsi, le coefficient de consanguinité (f) d’un individu X peut être calculé avec la formule suivante :

où n est le nombre d’individus dans la boucle considérée, et fA est le coefficient de consanguinité de l’ancêtre commun des parents de X.

C’est du chinois ?… Oui, un peu alors voyons ça sur notre exemple simple :

Dans la boucle jaune, il y a 5 individus et idem dans la verte & jaune donc le calcul sera 0,5**5×2 = 0,0625 soit 6,25%

Pourquoi limiter ce coefficient : afin de limiter le risque de propagation de maladies et notamment pour nous, celui de l’épilepsie pour lequel il n’existe pas de test.

En Angleterre, le COI du keeshond est donné de 6.6%.. En France ?… Je n’ai pas réussi à obtenir l’information de la SCC…

Pourquoi à notre sens il est important de regarder le COI sur 20 générations et non sur 5, contrairement aux recommandations de la SCC ?… Parce que les ancêtres communs se cachent parfois plus haut dans le pedigree… Mais apparaissent alors souvent également !?… Et c’est là qu’on s’aperçoit que non, l’hypothèse de dire que le COI des chiens de génération 5 était de 0 ne tient plus.

Pour aller plus loin sur la consanguinité chez le spitz loup :

Calcul du coefficient de consanguinité | Société Centrale Canine (centrale-canine.fr) : dans LOF Select vous avez l’information sur 5 génération sur la fiche d’un chien et vous pouvez simuler une aliance virtuelle => VISEZ LE 0.00% !!

une autre calculatrice (site canadien)

COI FAQS: Understanding the Coefficient of Inbreeding – The Institute of Canine Biology

Inbreeding consequences for the Keeshond | Keeshond Health (keeshondhealthmatters.co.uk)

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